Sequenziamento NGS

Next Generation Sequencing (NGS)

Ion Torrent Personal Genome Machine (PGM)

L'Ion PGM è il sistema ideale per il sequenziamento di piccoli genomi (virus, batteri...), per il DNA mitocondriale, per specifiche regioni genomiche o set di geni, per gli Small RNA, gli RNA exosomiali e RNA-seq di ampliconi.

Numero di genomi per run su Ion PGM System

Esempi di genomi sequenziabili su Ion PGM System

Per esempio: 

E. coli K-12 is 4.6Mb x 70X average coverage = 322 Mb of sequencing data

200-bp reads: 314 Chip output = 50 Mb; 316 Chip output = 600 Mb; 318 Chip output = 1 Gb

400-bp reads: 314 Chip output = 100 Mb; 316 Chip output = 1 Gb; 318 Chip output = 2 Gb